La Hermandad de Villaverde es muy antigua y, aunque se aprobaron sus reglas en 1571, hay constancia de que su existencia es anterior, fijando su fundación en 1565.
La devoción a la Virgen de Aguas-Santas fue tan grande en Sevilla y en los pueblos de la comarca, que existieron otras hermandades en la ciudad y en algunos pueblos de la Vega, como Alcalá del Rio. En Sevilla hubo una Hermandad fundada en 1565 y refundada en 1715, y otra firmada tambien en 1715.